V Podzámecké zahradě rostě platan javorolistý s obvodem kmene 510 centimetrů a věkem okolo 150 let. Zajímavou rostlinou je také liliovník tulipánokvětý v blízkosti Chytkova rybníka. Jihovýchodně od Kroměříže se nachází přírodní park Záhlinické rybníky. Přírodní památka Stonáč na katastrálním území městské části Bílany je bohatá na pobřežní a vodní vegetaci. V městské části Kotojedy se nachází hloh jednosemenný starý asi 120 let a obvodem kmene 188 centimetrů. Mezi Kotojedy a Těšnovicemi leží přírodní památka listnatý les Obora.